Seen

   Im Park gibt es 26 größere und kleinere natürliche Seen. Ihre Gesamtfläche beträgt 1484,2 ha. 90% der Fläche betragen drei größte Seen: Plateliai, Ilgis, Beržoras. Das Relief des Grundes dieser Seen ist kompliziert, in allen drei Seen gibt es Inseln (im See Plateliai-7, in Ilgis-2, in Beržoras-1). Der schönste, sauberste und tiefste See in Niederlitauen und im Nationalpark ist der See Plateliai. Seine Fläche beträgt 1205 ha, durchschnittliche Tiefe ist 10,5m, die tiefste Stelle ist 47m, der Wasserstand ist 146,5m über dem Meeresspiegel. Die Länge der Ufer ist etwa 31 km.
Auf dem Territorium des Parks gibt es viele kleine Seen, die Fläche 22 Seen ist bis zu 5 ha, 10 Seen davon haben die Fläche bis 1 ha.

In den Seen Burgis und Luokis gibt es Wasserlinsenkolonien, in den Seen Burgis, Burgalis und Skyplaičiai- Algenkolonien. Alle diese Seen können nach der Direktive der EU dem Typ der Seen mit Algenpopulation zugeordnet werden. Die Seen Vaivadė (Petreikis), Burgis, Endriuškaičiai, besonders ihre torfigen Buchten sind mit Laichkraut bewachsen. In diesen Seen gibt es vielen natürlichen Nährstoffen. Sie werden dem Typ – natürliche eutrophische Seen mit Laichkrautpopulation zugeordnet. Im Park gibt es kleine Seen, die von Mooren umgeben sind. Sie werden dem Typ- natürliche distrophische Seen zugeordnet. In diesen Seen gibt es fast keine Pflanzen, das Wasser ist wegen Torf und Humussäuren braun. Solche torfige sumpfige Seen sind Lestis, Piktežeris, Aklaežeris.