Im Park sind 673 hiesige, 138 fremde Pflanzenarten und 214 Moosarten registriert. 66 Pflanzenarten stehen im Roten Buch Litauens. Dort wachsen in ganz Europa beschützten Arten: Botrychium simplex, Liparis loeselii, Hamatocaulis vernicosus. Im Park wurden Pflanzen aus der Eiszeit gefunden: Cladium mariscus, Trichophorum cespitosum, Carex magellanica, Lunaria rediviva, Salix lapponum, Primula farinosa.
Die Kenner der Pflanzenwelt sind erstaunt von der zahlreichen Population Platanthera chlorantha, Pinguicula vulgaris, Dactylorhiza maculata, Dactylorhiza ochroleuca, Dactylorhiza longifolia, Liparis loeselii, Listera cordata. Hier wurde bis jetzt die einzige natürliche Vegetationszone Botrychium simplex in Litauen gefunden. Für manche Pflanzenarten ist das Territorium des Parks Verbreitungsgrenze; nördliche- für Mentha longifolia, nordwestliche- für Aguilegia vulgaris, östliche- für Trichophorum cespitosum.